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產(chǎn)品詳情

WH0202 rRNA去除試劑盒(人/小鼠/大

  • 產(chǎn)品/服務:WH0202 rRNA去除試劑盒(人/小鼠/大
  • 型 號:WH0202
  • 品 牌:百奧萊博
  • 單 價:面議 
  • 更新日期:2023-06-05
  • 有效期至:長期有效
  • 瀏覽次數(shù):1121
產(chǎn)品簡介

rRNA去除試劑盒(人/小鼠/大是高品質(zhì)的RNA提取純化產(chǎn)品,由北京百奧萊博供應,本產(chǎn)品用于生化實驗研究等領(lǐng)域,本品質(zhì)量穩(wěn)定,價位合理,需要rRNA去除試劑盒(人/小鼠/大等RNA提取純化產(chǎn)品的客戶,請到我公司官網(wǎng)聯(lián)系我們。...

產(chǎn)品詳細介紹

特別提示:包括rRNA去除試劑盒(人/小鼠/大鼠)在內(nèi),本公司的所有產(chǎn)品僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!


產(chǎn)品名稱:rRNA去除試劑盒(人/小鼠/大鼠)
英文名稱:rRNA Depletion Kit
產(chǎn)品貨號:WH0202
產(chǎn)品規(guī)格:6次|24次|96次

本試劑盒采用特殊設計的DNA探針與核糖體RNA(rRNA)雜交,隨后利用Ribo RNase H降解DNA-rRNA雜交鏈中的rRNA,從而去除人、小鼠、大鼠總RNA中的細胞質(zhì)核糖體RNA(28S、18S、5.8S、5S)和線粒體內(nèi)核糖體RNA(16S、12S),保留信使RNA(mRNA)和其它非編碼RNA。

該試劑盒對于完整和部分降解的總RNA(如FFPE RNA)均具有良好的rRNA去除效果,所獲得的去除了rRNA的RNA樣本可用于mRNA和非編碼RNA高通量測序,可顯著提高測序結(jié)果中有效數(shù)據(jù)比例,純化產(chǎn)物也可用于隨機引物cDNA合成或其它下游應用。

產(chǎn)品特點:
·樣本廣泛:適用于高質(zhì)量(完整)及部分降解(如FFPE)樣本中rRNA的去除。
·去除:有效去除95~99.9%的人/小鼠/大鼠的rRNA。
·數(shù)據(jù):保留了不完整mRNA和非編碼RNA信息,使轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)更加。
·快速評估:試劑盒中提供的引物可快速評估rRNA的去除效果。

產(chǎn)品組成:
組分 6次 24次 96次
Ribo Hybridization Probe(H/M/R) 6μl 24μl 4×24μl
5×Hybridization Buffer 18μl 72μl 4×72μl
Ribo RNase H 6μl 24μl 4×24μl
5×RNase H Buffer 24μl 96μl 4×96μl
Ribo DNase I 6μl 24μl 4×24μl
10×DNase I Buffer 30μl 120μl 4×120μl
RNase-Free ddH2O 1ml 2×1ml 8×1ml
rRNA Primer Mix 12μl 48μl 4×48μl
mRNA Primer Mix 12μl 48μl 4×48μl

儲存條件:-20℃保存,保質(zhì)期為一年,盡量避免反復凍融。

注意事項:請務必在使用本試劑盒之前閱讀此注意事項。
1.操作過程請注意避免核酸樣品和產(chǎn)物之間的交叉污染。
2.請使用不含RNA酶或DNA酶的槍頭、離心管進行實驗。
3.實驗開始前,請清潔操作臺,建議使用RNA酶及DNA酶清除試劑處理臺面。確保沒有RNA酶和DNA酶的污染。

推薦使用的其他試劑:
1.去除rRNA的RNA純化:RNA Clean Beads (Cat#NG307)。
2.PCR檢測rRNA去除效率,QuickKing RT Kit (With gDNase)(Cat#KR116),SuperReal PreMix Plus(SYBR Green)(Cat#WH0103)。

操作流程示意圖:
rRNA去除試劑盒操作流程示意圖

操作步驟:

一、探針與rRNA雜交
1.在200μl Nuclease-Free PCR管中,用RNase-Free ddH2O將100~1000ng人/小鼠/大鼠的總RNA稀釋至11 μl,冰上放置備用。
  注意:總RNA樣品中應無DNA、鹽離子(例如Mg2+、胍鹽)、有機試劑(例如酚、乙醇)殘留,否則可能導致非預期的RNA降解或去除效率降低。
2.參照下表配制探針反應液:
成分 使用量
5×Hybridization Buffer 3μl
Ribo Hybridization Probe(H/M/R) 1μl

3.將步驟2的4 μl探針反應液加入到步驟1裝有11 μl RNA樣品的PCR管中,用移液器吸吹混勻10次。
4.瞬時離心,將樣品置于PCR儀中(啟用熱蓋99~105℃均可),按以下程序操作,總共耗時約20min。
  注意:必須慢速降溫(每秒降溫0.1℃),使探針與rRNA充分雜交。
步驟 溫度 時間
1 95℃ 2min
2 95 to 22℃ 0.1℃/sec
3 22℃ 5min hold

5.瞬時離心,并置于冰上,立即進入下步操作。

二、Ribo RNase H消化rRNA
1.參照下表在冰上配制Ribo RNase H反應液,并用移液器吸吹混勻10次。
成分 使用量
5×RNase H Buffer 3μl
Ribo RNase H 1μl

2.將5 μl Ribo RNase H反應液加入步驟一的產(chǎn)物中,構(gòu)成20 μl反應體系,用移液器吸吹混勻10次。
3.瞬時離心,將樣品置于PCR儀中(啟用熱蓋40℃),37℃孵育30 min。
4.瞬時離心,將樣品置于冰上,立即進入下步操作。

三、Ribo DNase I消化探針
1.參照下表在冰上配制Ribo DNase I反應液,并用移液器輕輕吸吹混勻10次。
成分 使用量
RNase-Free ddH2O 24 μl
10× DNase I Buffer 5 μl
Ribo DNase I 1 μl

2.將30 μl Ribo DNase I反應液加入步驟二的產(chǎn)物中,構(gòu)成50 μl反應體系,用移液器吸吹混勻10次。
3.瞬時離心,將樣品置于PCR儀中(啟用熱蓋40℃),37℃孵育30 min。
4.瞬時離心,將樣品置于冰上,立即進入下步操作。

四、RNA純化
推薦使用磁珠純化產(chǎn)品RNA Clean Beads(Cat#NG307),也可使用Agencourt RNAClean XP(Beckman Coulter)。
1.渦旋振蕩混勻RNA Clean Beads,吸取110 μl (2.2倍體積)至步驟三的50 μlRNA產(chǎn)物,用移液器吸吹混勻10次。
2.冰上靜置15 min,使RNA充分結(jié)合到磁珠上。
3.將樣品置于磁力架上5 min,待溶液澄清后,用移液器小心移除上清。
4.保持樣品始終處于磁力架上,加入200μl新鮮配制的80%乙醇(每次實驗需要新鮮配制,因為乙醇易從空氣中吸收水分,濃度降低影響實驗效果)漂洗磁珠(不要吹散磁珠),室溫孵育30 sec,小心移除上清。
5.重復步驟4進行漂洗。
6.取出離心管短暫低速離心(<2000g,10 sec),使液體收集至管底,將樣品放回磁力架,用移液器小心棄去所有液體。
7.保持樣品始終處于磁力架上,開蓋晾干磁珠3~5 min (不要過度干燥,否則可能降低RNA回收率。洗脫應當在磁珠依然顯深棕色且光亮,而且所有可見液體已完全揮發(fā)時進行。若磁珠出現(xiàn)裂縫,則表示已過度干燥)。
8.將樣品從磁力架上取出,加入12 μl RNase-Free ddH2O (或適合下游實驗的相應體積ddH2O或洗脫緩沖液),用移液器吹打10次混勻磁珠,室溫靜置2 min。
9.在磁力架上靜置2 min,待溶液澄清后,不要觸動磁珠,小心吸取10 μl上清(可根據(jù)步驟8選擇的實際洗脫體積進行相應調(diào)整,盡量充分利用洗脫產(chǎn)物)至新的Nuclease-Free PCR管。
10.洗脫樣品可立即用于RNA測序文庫構(gòu)建或其他分析應用,也可在-20℃保存過夜或在-80℃保存7天。

五、Real-time PCR檢測(可選步驟)
本試劑盒提供兩對定量PCR引物,分別為18S rRNA的rRNA Primer Mix和beta-actin的mRNA Primer Mix。建議以不進行處理的等量初始總RNA為對照(需用RNase-Free ddH2O或洗脫緩沖液稀釋至洗脫體積),以評估rRNA去除效率和mRNA損失比例。
兩步法舉例:逆轉(zhuǎn)錄用1μl的RNA產(chǎn)物作模板,合成鏈cDNA,然后定量PCR用2 μl cDNA作模板。試劑盒使用QuickKing RT Kit(With gDNase)(Cat#KR116)和SuperReal PreMix Plus (SYBR Green)(Cat#WH0103)。

根據(jù)您的關(guān)注的rRNA去除試劑盒(人/小鼠/大鼠),核糖體RNA清楚試劑盒,核糖體RNA去除試劑盒,您可能還對以下產(chǎn)品有需求:



名稱:植物RNA柱式提取試劑盒
貨號:BTN71203
規(guī)格:50次
本試劑盒是植物RNA提取試劑盒(BTN3080)的柱式升級產(chǎn)品,它結(jié)合了BTN3080性(其效果在近五十多種各類植物中得到驗證,植物名單見BTN3080產(chǎn)品介紹的附錄)和百奧萊博柱式純化系列產(chǎn)品的快捷性。

試劑盒特點:
1. 操作更加簡單快速,處理一個樣品只需要約十分鐘,比植物RNA提取試劑盒快一倍。
2. RNA純度更高,平均 OD260/280一般都在2.0左右,能夠有效去除大多數(shù)植物中的多糖污染。
3.小RNA回收效率更高。
4.適用于所有用植物RNA提取試劑盒能提出RNA的植物(注:對有些植物可能需要在溶液A中額外添加RVC)。
5. 得到的RNA可直接用于RT-PCR、Northern雜交、cDNA合成等實驗。
6. 高于進口的柱式植物RNA提取產(chǎn)品。
7.一站式,提供RNase-free的樣品收集管。

試劑盒組成:
成分 規(guī)格
溶液A 50ml
溶液B 15ml
溶液C 50ml
離心吸附柱 50套
通用洗柱液 50ml
RNA洗脫液 10ml
說明書 1份

注:溶液B為淡黃色液體,使用前請觀察顏色是否正常。若溶液B有油粒狀顆粒及分層,屬正?,F(xiàn)象,不影響使用。

儲存條件:常溫運輸,4℃保存,有效期一年。

使用方法:
1. 估算組織細胞的用量。每次微量提取一般需要100-200mg植物葉片、或50-100mg植物種子、或200-500mg植物果實。
2. 先將新鮮植物組織剪切成小塊(保存在RNAhold中的植物組織需用紙吸去RNAhold液體后再剪切成小塊),放入10-15mL塑料離心管中,加入1mL溶液A,然后用勻漿器勻漿5-20秒。勻漿時會產(chǎn)生泡沫,但不影響提取效果。也可以使用液氮硯磨法破碎植物組織,硯磨完后加入1mL溶液A。注意:溶解溶液A沉淀。溶液A在4℃放置后可能會產(chǎn)生沉淀,使用前必須放在65℃水浴使沉淀徹底溶解并充分搖勻后再取用。
3. 將勻漿物或硯磨物轉(zhuǎn)移至干凈的1.5mL塑料離心管中(可以不必轉(zhuǎn)移非液體的細胞碎片)。有的植物組織(比如果實)含有大量水份,勻漿液會多于1mL,轉(zhuǎn)移時也只取1mL。
4.在離心管中加入0.3mL的溶液B和0.2mL自備lǜ仿,在振蕩器上振蕩30秒混勻,此時溶液呈均勻的乳濁狀。振蕩器振蕩時必須使管底溶液震蕩起來。
5.室溫12000~15000g離心3~5分鐘,兩相間將有約5-10毫米厚的細胞破碎物。
6. 將上清液(約0.6mL)轉(zhuǎn)移到另一干凈的1.5mL塑料離心管中,下層有機相和中間層含有DNA、蛋白質(zhì)和其他雜質(zhì),避免觸及或吸取。zuì好留下100μL上清液不取。
7. 加入等體積的溶液C,充分顛倒混勻。如果有沉淀產(chǎn)生(對某些植物,屬于正常現(xiàn)象),千萬不要去掉沉淀,一定要把所有的混合物上柱。
8. 將一半的溶液(如果有沉淀,則先混勻)轉(zhuǎn)移到離心吸附柱中,13000-15000g室溫離心半分鐘,棄穿透液。
9. 將剩下的一半溶液(如果有沉淀,則先混勻)轉(zhuǎn)移到同一離心吸附柱中,13000-15000g室溫離心半分鐘,棄穿透液。
10. 加0.7mL通用洗柱液,室溫離心半分鐘,棄穿透液。再加0.3mL通用洗柱液,室溫離心半分鐘,棄穿透液。一般樣品如此洗滌兩次即可,但如果在第7步加入溶液C后有沉淀產(chǎn)生,則需要洗三次,每次加入的通用洗滌液的量分別為0.4、0.3和0.3mL。
11.室溫離心半分鐘。此步十分重要,否則殘留的乙醇會影響RNA的使用。
12. 將離心吸附柱轉(zhuǎn)移到RNase-free收集管中,加入50-100μl RNA洗脫液,室溫放置1-2分鐘。
13. 13000-15000g室溫離心半分鐘,離心管中溶液即為RNA樣品,可以立即使用或存放于-80℃待用。
14. RNA完整性的電泳檢測:如果需要做Northern雜交,強烈建議用戶使用甲醛變性膠進行RNA電泳,因為非變性膠不能分離所有的RNA分子(BioTechniques,28:414,2000)。
15. RNA產(chǎn)量產(chǎn)率測定:將5-10μl RNA溶于TE緩沖液中(pH7.5-8.2之間)檢測其在OD260的光吸收。通過光吸收可以得出RNA濃度(1 OD260的RNA=40μg/mL),進而計算出RNA的產(chǎn)量(濃度×體積)和產(chǎn)率(RNA產(chǎn)量/組織用量)。
16. RNA純度測定:無污染的總RNA的OD260/OD280一般在1.8-2.1之間(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān)),高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質(zhì)污染,但一般不影響RT-PCR等反應。

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