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多重PCR擴(kuò)增試劑盒,你使用對(duì)了嗎?
發(fā)布時(shí)間:2019-09-04瀏覽次數(shù):2047返回列表
試劑盒的正確使用與否直接關(guān)乎著試驗(yàn)的成功與否,快來對(duì)照一下多重PCR擴(kuò)增試劑盒,你使用對(duì)了嗎!
所謂多重PCR(Multiplex Polymerase Chain Reaction,mPCR),也稱復(fù)合PCR,由Chambehian' 在1988年提出(Chambehian' et.al.Nucleic Acids Res、1988 Dec 9; 16(23): 11141–11156.),基本原理與常規(guī)PCR相同,區(qū)別在于多重PCR的反應(yīng)體系是加入多對(duì)引物,各對(duì)引物分別結(jié)合在模板的相應(yīng)位置,zui終擴(kuò)增出多條DNA片段。
多重PCR實(shí)驗(yàn)流程
相比于液相雜交,多重PCR的是特異性強(qiáng),實(shí)驗(yàn)周期短,技術(shù)也相對(duì)簡(jiǎn)單。下面為大家介紹實(shí)驗(yàn)流程:
我們公司多重PCR的實(shí)驗(yàn),就是由兩輪PCR完成。di一輪PCR的作用是利用目標(biāo)區(qū)域特異的引物去擴(kuò)增,得到的產(chǎn)物是目標(biāo)區(qū)域的富集片段,因此,此步驟也是實(shí)現(xiàn)了從基因組中“捕獲”目標(biāo)區(qū)域的目的。
之后把得到的產(chǎn)物進(jìn)行純化,再通過第二輪PCR中引入Index和Adaptor。
這樣,在經(jīng)過了兩輪PCR后,就獲得了完整的文庫。把第二輪PCR產(chǎn)物純化后,就可以定量,測(cè)序了。
實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng):
1、先從樣本說起,我們公司的多重PCR平臺(tái)可以做的樣本包括血液,唾液,口腔拭子,在實(shí)驗(yàn)中,對(duì)于DNA投入量要求不是很高,根據(jù)不同項(xiàng)目需求,DNA投入量的范圍在100 pg到100 ng 之間。
2、進(jìn)行PCR反應(yīng)前,可以將所有 gDNA 的濃度稀釋到同一濃度,并轉(zhuǎn)移到 PCR 8 聯(lián)管中,一方面是便于排槍操作,另一方面是加入相同起始量的 gDNA,這樣可以降低zui終文庫的濃度差異,便于混合文庫。
3、大多數(shù)情況下引物是1管,操作相當(dāng)方便;當(dāng)目標(biāo)區(qū)域是外顯子或者是其他連續(xù)區(qū)域時(shí),我們會(huì)把引物分裝為2管,分別命名Primer pool T1與Primer pool T2,這時(shí)需要第二輪PCR前把產(chǎn)物合并,再進(jìn)行下一步反應(yīng)。
4、執(zhí)行多重PCR反應(yīng)時(shí),特別是樣本量多的情況下,可以將 T1 設(shè)為一組,T2 設(shè)為一組,便于制備反應(yīng)試劑混合液和排槍操作; 并把解凍好的試劑放置在冰盒上,在冰盒上進(jìn)行加樣操作。
5、在實(shí)驗(yàn)中,可以在PCR管壁上和管蓋上同時(shí)進(jìn)行反應(yīng)編號(hào)標(biāo)記,防止高溫或其他原因?qū)е掠浱?hào)消失,避免后續(xù)產(chǎn)物混合操作失誤, 造成樣本交叉污染。
6、第二輪PCR后,因?yàn)?/span>YF Buffer B試劑比較粘稠,在清洗純化的時(shí)候不能吸走所有試劑,可以剩余5-10μl,否則會(huì)把磁珠一起吸走,造成樣品的損失,導(dǎo)致產(chǎn)物回收率下降。
當(dāng)實(shí)驗(yàn)完成后,正常文庫濃度處于5-30 ng/μl,而片段長(zhǎng)度一般在280-460 bp之間,且主峰前后無雜峰,就可以進(jìn)行測(cè)序了。
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