20世紀(jì)90年代初期，支撐深圳經(jīng)濟(jì)發(fā)展的加工貿(mào)易業(yè)出現(xiàn)嚴(yán)重滑坡，促使深圳市踐行創(chuàng)新發(fā)展戰(zhàn)略，尋找科技資源以支撐高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展，力求突破技術(shù)缺乏、人才缺乏的制約；同一時(shí)期，國(guó)務(wù)院提出了“科技工作面向國(guó)民經(jīng)濟(jì)主戰(zhàn)場(chǎng)”的口號(hào)，號(hào)召?gòu)?qiáng)化技術(shù)開(kāi)發(fā)和推廣，加速科技成果商品化、產(chǎn)業(yè)化的進(jìn)程。為了在高校和企業(yè)之間、科研成果和市場(chǎng)產(chǎn)品之間建設(shè)橋梁，清華大學(xué)與深圳市政府創(chuàng)建了深圳清華大學(xué)研究院，其戰(zhàn)略目標(biāo)為“服務(wù)于清華大學(xué)的科技成果轉(zhuǎn)化、服務(wù)于深圳的社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展”，從此開(kāi)啟了中國(guó)新型科研機(jī)構(gòu)的嶄新探索。